أكدت مشيخة الأزهر الشريف خلوَّ منصب رئيس الجامعة بقرار المجلس الأعلى للأزهر الصادر في 3 أبريل 2013 بالدعوة فورًا لانتخابات رئاسة الجامعة، وتشكيل لجنة لوضع قواعد الانتخاب، وعرضها على المجلس الأعلى للأزهر، في مدة لا تزيد عن أسبوعين.
وشدد على أن إجراء انتخابات رئاسة جامعة الأزهر واضحٌ لا لبس فيه، على أن تبدأ إجراءات الانتخاب فور إقرار قواعد الانتخاب من جانب المجلس الأعلى للأزهر.