كانت نيابة الانقلاب الكلية بجنوب أسيوط، قد وجهت لهم تهمًا ملفقة على خفية معارضتهم للحكم العسكري والانقلاب على الشرعية.
ومن أبرز المتهمين في القضية: د. جلال عبد الصادق مسئول المكتب الإداري للإخوان المسلمين بالمحافظة، ود. على عز الدين ثابت أمين حزب الحرية والعدالة بأسيوط وعاصم عبد الماجد القيادي بالجماعة الإسلامية، وأشرف عمر نائب مسئول المكتب الإداري والمتحدث الإعلامي لإخوان أسيوط، ود.حسين راغب أمين الإعلام بحزب الحرية والعدالة، ود.عبد العزيز خلف وسمير خشبة عضوي مجلس الشعب السابقين، والشهيد عبد الرحمن الرزاحي عضو المكتب الإداري لإخوان أسيوط، و د. مصطفى إسماعيل والمهندس الحسيني لزومي.